Hoe bacterieel DNA knippen zonder menselijk DNA te knippn? En hoe dat kapot bacterie-DNA eruit halen?

Antwoord

Beste Jens,

Bacterien bevatten vaak twee soorten DNA (een grote circel van een paar miljoen bouwstenen; ook nucleotiden genoemd; er zijn vier verschillende nucleotiden A, G, C en T). Sommige bacterien bevatten vaak ook plasmiden (dit zijn kleinere circeltjes van een paar duizend bouwstenen). De structuur van het DNA in bacterien is dezelfde als bij de mens. Ook menselijke cellen bevatten DNA (in dit geval oa lineaire chromsomen; ons grootste chromosoom bevat ongeveer 200 miljoen bouwstenen).

Het is inderdaad zo dat als men gaat werken met oud DNA (bv van een Neanderthaler of mammoet of andere uitgestorven levend organisme) dat er in dit DNA ook vaak DNA aanwezig is van micro-organismen (bacterien, schimmels, ...).

Als men dit DNA zal knippen zal men dus inderdaad zowel het bacterie-DNA als het DNA van de Neanderthaler, mammoet, ....) knippen. Men bekomt dan een mengsel van (relatief kleine) stukjes van bv 500 bouwstenen. Op basis van grootte zal men geen verschil zien tussen bacterie DNA en DNA van organisme X. Maar, men kan in het laboratorium de individuele DNA stukjes opzuiveren (we spreken van DNA stukjes cloneren in een vector). Vervolgens kan men van individuele stukjes DNA de opeenvolging van de bouwstenen (de DNA sequentie) gaan bepalen en kan men dan -op basis van DNA databanken- gaan kijken of het over bacterie DNA of ander DNA gaat (van organisme X). Tegenwoordig is het zelfs niet meer nodig om stukjes DNA apart te gaan cloneren in een vector. Men kan rechtstreeks de DNA sequentie bepalen van DNA stukjes in een mengsel...